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Le Sol Vivant

S Sol

La strate Sol décrit la matrice physique, chimique et biologique. De l'eau et la porosité jusqu'au microbiome bactérien et fongique, en passant par les grands cycles biogéochimiques (C, N, P, S, Fe) et la thermodynamique redox.

Ouverture

Le récit de la strate — par où commencer, avant les chapitres qui suivent.

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S0 — L'Eau dans le Sol Vivant

16 fiches — en continu ou au choix.

L'eau dans le sol vivant — Potentiels, continuum SPAC, résilience hydrique transversale — aussi dans S1 · V2 · P4 Profil sol hydromorphe/organique : redox bas, émissions, gestion de l’eau centrale zoom — aussi dans S1 · S4 Plastiques biosourcés et/ou biodégradables en fin de vie zoom — aussi dans S1 Points chauds et moments chauds (hot spots, hot moments) — hétérogénéité spatio-temporelle des flux zoom — aussi dans S2 · S4 Effet Birch — pulse de minéralisation à la réhumectation des sols zoom — aussi dans S2 · S4 Diagnostiquer la santé du sol au champ : indicateurs simples, des fonctions à la décision transversale — aussi dans S1 · S2 · S4 Les états de l'eau et la biologie du sol transversale — aussi dans S1 · V2 Haies, bocage et brise-vent — fonctions sol, lisière et microclimat zoom — aussi dans S2 · S4 Silvopastoralisme tempéré — arbre, prairie et animal zoom — aussi dans S2 · S4 Pompage nutritif profond et filet de sécurité racinaire zoom — aussi dans S2 · S4 Trognes et arbres-ressources — biomasse renouvelable et rôle écologique zoom — aussi dans S2 · S4 L'animal dans le cycle de fertilité — déjections, coprophages et couplage culture-élevage zoom — aussi dans S2 · S4 Tolérance à la sécheresse médiée par le microbiome — de l'osmolyte au rhizosheath zoom — aussi dans S2 · V2 Eau douce, épuration et sol — valoriser les biomasses aquatiques comme amendements zoom — aussi dans P3 Battance et croûte de surface : mécanismes, diagnostic et remédiation concept — aussi dans S2 L'holobionte ingénieur de sa niche : quand le vivant installe ses conditions (riz noyé, biocroûtes) zoom — aussi dans V2

S1 — Architecture du Sol

22 fiches — en continu ou au choix.

Thermodynamique Redox des Sols transversale — aussi dans S4 · P2 Amendements minéraux structurants : marnage, chaulage, gypse, poudres de roche et articulation avec la fraction organique transversale — aussi dans S4 · P1 · P2 Plantes bio-indicatrices — lecture visuelle du sol et diagnostic praticien transversale — aussi dans S4 · V1 · V2 · P1 Drilosphère et MAOM — le tube digestif du ver comme bioréacteur de stabilisation du carbone transversale — aussi dans S4 · V1 · P2 Mode d application des amendements — surface versus incorporation et incidence pédologique transversale — aussi dans S4 · P1 · P2 · P3 Lombriciens — écologie, services et pilotage des populations transversale — aussi dans S2 · S4 · P1 · P2 · V2 · V1 Cascade phosphore — du minéral inerte à l'os humain transversale — aussi dans V2 · S3 · S2 · H1 Calcaire actif — protocole Drouineau et interprétation pour sols calcaires technique — aussi dans P1 Glomaline : glycoprotéine fongique et stockage C profond zoom — aussi dans S3 · S4 · V1 Mésofaune : collemboles et acariens, régulateurs des micro-habitats zoom — aussi dans S2 · V1 Bascule paradigme microzones anoxiques : demande biologique vs géométrie de l'agrégat zoom — aussi dans S2 · S4 Microsites zoom — aussi dans S2 · S4 Hiérarchie des agrégats et co-évolution structure-fonction zoom — aussi dans S2 Complexe argilo-humique (CAH) — passerelle FR ↔ MAOM zoom — aussi dans S4 Le chiendent comme bioindicateur du compactage zoom — aussi dans P1 · P2 · S0 La texture du sol : trois grains, une surface, un contenant La porosité : l'architecture du vide qui fait respirer le sol zoom L'adsorption : l'interface où le sol retient — et relâche zoom — aussi dans S4 Oxydes de fer et d'aluminium : les surfaces réactives du sol zoom — aussi dans S4 Podzol et toxicité aluminique : le microbiote racinaire au secours du moignon zoom — aussi dans S2 · V2 Films IRIS : cartographier les microzones réductrices du sol concept — aussi dans S4 Mull, Moder, Mor : lire les formes d'humus dans le paradigme du continuum zoom

S2 — Le Microbiome du Sol

33 fiches — en continu ou au choix.

Microbiome du sol vivant et thermotolérance des plantes revue_critique — aussi dans S3 · V2 · S4 · P2 Quorum Sensing et Communication Chimique Rhizosphérique transversale — aussi dans V2 · P1 Les Archées du Sol — Un Troisième Domaine Sous-estimé transversale — aussi dans S4 Le Cycle du Fer et les Bactéries Ferro-réductrices transversale — aussi dans S4 Bactéries pourpres non sulfureuses — biofertilisation photosynthétique multi-fonctionnelle transversale — aussi dans S4 · V3 · P3 Régulation trophique top-down — de la prédation microbienne à la suppressivité des maladies transversale — aussi dans V1 · P1 · P3 Mémoire microbienne paléoclimatique — héritage 20 000 ans transversale — aussi dans S4 · V2 Photofermentation et bactéries phototrophes pourpres non-sulfureuses (PNSB) : Rhodopseudomonas palustris pivot transversale — aussi dans V1 · V2 Exclusion compétitive et saturation de niche : suppressive soils, JADAM-JMS prophylactique, biocontrôle par diversité transversale — aussi dans V2 Diversité fongique dual rôle producteur/régulateur : les champignons comme acteurs ambivalents des cycles biogéochimiques zoom — aussi dans S3 · V2 Scavenging vs Mining : stratégies fongiques d'acquisition des nutriments dans le sol zoom — aussi dans S3 · V2 Plant diversity drives rhizosphere microbiome zoom — aussi dans S3 · V2 Tri-trophic interactions CEP / Trichoderma / soil mites zoom — aussi dans S3 · V2 Microbial necromass on the rise zoom — aussi dans S4 Interconnexion des microbiomes entre environnements — conséquences pour la santé humaine et planétaire zoom — aussi dans V2 · H1 Root exudates contribute to belowground ecosystem hotspots: A zoom Comammox Nitrospira et nitrification — réponse à la fertilisation longue durée (Alfisol Nord-Est Chine) zoom Carbon Use Efficiency microbienne — pivot stockage/respiration zoom — aussi dans S4 Mesurer la biodiversité du sol — cadre Marcon et nombres de Hill methodologique — aussi dans V1 · P1 Fertilité auto-entretenue : les fonctions biologiques du sol qui réduisent la dépendance aux intrants de synthèse transversale — aussi dans S3 · P3 · P5 · F2 Le microsite anoxique comme refuge évolutif : conservation du vivant ancestral et innovation génétique à l’abri zoom — aussi dans S4 · F1 La fonction hydraulique de la matière organique humifiée — retenir l'eau au-delà du stock de carbone zoom Test Haney et amorçage épigénétique foliaire — une intersection à explorer zoom — aussi dans V2 · F2 · P1 · H1 · S3 Exclusion compétitive : la défense qui n'attaque pas — saturation de niche et résistance d'invasion zoom — aussi dans V2 La structuration du microbiome : assemblage, core microbiome et coalescence transversale Le microbiome de la graine : l'héritage microbien de la plante-mère zoom — aussi dans V2 Les rhizobactéries promotrices de croissance (PGPR) : l'armée microbienne de la rhizosphère transversale Les effets de priorité : quand l'ordre d'arrivée fait la communauté zoom La plastisphère : le biofilm microbien des microplastiques du sol zoom — aussi dans S3 La phagothérapie végétale : des bactériophages contre les phytopathogènes transversale — aussi dans V2 La rhizosphère : la zone d'influence où la plante parle au sol zoom — aussi dans V2 L'éthylène : l'hormone gazeuse qui sent la compaction du sol zoom — aussi dans V2 Croûtes biologiques du sol (biocrusts) : la peau vivante qui amorce la pédogenèse zoom — aussi dans V2

S3 — Le Microbiome Fongique et Mycorhizien

11 fiches — en continu ou au choix.

Les Champignons Entomopathogènes dans le Sol concept — aussi dans V2 · P3 Mycorhizes arbusculaires (AM) et ectomycorhizes (ECM) — Symbiose et Echanges Fonctionnels transversale — aussi dans V2 · F1 Champignons entomopathogènes — double identité et lutte par conservation transversale — aussi dans V2 · P3 Réseau mycorhizien commun — controverse Simard vs Karst 2023 transversale — aussi dans V2 · P4 · F1 Endophytes ubiquitaires et potentiel pathogène latent zoom — aussi dans V1 · V2 Récepteurs ancestraux et détournement évolutif (exaptation) : KAI2, le cas-type des Orobanchacées zoom — aussi dans V1 · V2 Holobionte rhizosphérique des arbres fruitiers : microbiome, virome et syndrome de replantation zoom — aussi dans P4 · V2 Mycorrhiza-mediated competition drives soil C zoom — aussi dans S4 · V2 Arbuscular mycorrhiza: advances and retreats in our understanding of the ecologi zoom — aussi dans V2 Hydrophobie du sol (SWR) : quand le sol refuse l'eau concept — aussi dans S4 Eucalyptus × Pisolithus : installer la vie sur un résidu minier acide zoom

S4 — Le Carbone et les Grands Cycles

35 fiches — en continu ou au choix.

Stœchiométrie CNPS de Kirkby et bilan AMG zoom — aussi dans S1 · P1 · P2 Le Soil Continuum Model — Fin du Paradigme de l'Humification transversale — aussi dans S1 Les Cycles Couplés C-N-P-S-Fe dans les Sols transversale Le Cycle du Potassium dans les Sols Vivants transversale — aussi dans P1 Carences minérales silencieuses — de l appauvrissement du sol à la santé publique transversale — aussi dans H1 · H2 · F2 Pompe microbienne à carbone — la nécromasse comme voie dominante de stabilisation du MAOM transversale — aussi dans S1 · S3 · F1 · P2 Couplages biogéochimiques Fe-P-S-N sous alternance redox transversale — aussi dans S0 · S1 · P1 · H1 Priming effect rhizosphérique : de la stimulation microbienne au bilan net carbone transversale — aussi dans S2 · V2 · P1 · P2 Glycoprotéines fongiques — glomaline et GRSP, pivot de la pompe carbone transversale — aussi dans V2 Métaux lourds — exclusion mycorhizienne et sécurité alimentaire One Health transversale — aussi dans V2 · H1 Enhanced Rock Weathering (ERW) — CDR émergent et cation bridging MAOM transversale — aussi dans F2 · P1 · P2 · P4 · F1 · H1 Bokashi anaérobie vs compostage thermophile : conservation matière organique, pertes azote, empreinte carbone transversale — aussi dans P3 · V3 · P5 Solubilisation acide de minéraux insolubles : KNF-WCA/WCP, JADAM phyllite, MMS Paniagua transversale — aussi dans P3 Controverses sur le stockage du carbone du sol : trois paradigmes en débat zoom Trade-off plant vs soil C under elevated CO2 zoom — aussi dans F1 Mineral protection counteracted by root exudates zoom Saturation MAOM et plafond de séquestration carbone zoom Cycle du soufre : du sol à la santé humaine transversale — aussi dans S2 · V2 · H1 Le carbone inorganique du sol : carbonates pédogéniques, dynamique et bilan carbone transversale — aussi dans S1 Le zinc, du sol à la nutrition humaine : disponibilité, absorption et biofortification transversale — aussi dans S3 · V2 · H1 Le sélénium, du sol à la santé humaine : analogue du soufre à marge étroite transversale — aussi dans V2 · H1 L'iode, du sol à la thyroïde humaine : un maillon ténu, une carence évitable transversale — aussi dans V2 · H1 Le magnésium, du sol à la nutrition humaine : mobilité, antagonismes cationiques et chlorophylle transversale — aussi dans V2 · H1 Le bore, du sol à la plante : disponibilité, paroi cellulaire et marge étroite transversale — aussi dans V2 Le manganèse, du sol à la plante : redox, photosynthèse et disponibilité transversale — aussi dans S2 · V2 · H1 Le cuivre, du sol à la plante : transport électronique, lignification et accumulation transversale — aussi dans V2 · H1 Le fer, du sol à la nutrition humaine : disponibilité, chlorose et anémie ferriprive transversale — aussi dans S2 · V2 · H1 La matière organique du sol : deux carbones, un plafond, une recette Photofermentation : la photosynthèse sans oxygène — versatilité métabolique des bactéries pourpres zoom — aussi dans V3 Solubilisation acide des minéraux : dissoudre la roche comme une racine — du WCA à l'altération biologique zoom — aussi dans V3 Le cycle de l'azote : de la fixation symbiotique à la fuite N₂O transversale Le N₂O et l'inhibition de la nitrification : fermer le robinet, ouvrir le puits zoom Le legacy phosphorus : le gisement enfoui sous nos fermes zoom Les PFAS dans le sol agricole : des polluants éternels à tenir hors du cycle transversale La biosphère profonde : la vie habite la roche jusqu'à plusieurs kilomètres zoom — aussi dans F1