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Le Sol Vivant

qPCR du sol

EN : Soil qPCR standard

Définition

Technique de biologie moléculaire permettant la quantification en temps réel de fragments d'ADN cibles extraits directement de la matrice sol (Bouchez et al., 2016; Collin & Lelièvre, 2022). Elle permet de mesurer l'abondance absolue de groupes taxonomiques spécifiques (ex : ADNr 16S/18S pour les bactéries/champignons) ou de gènes fonctionnels (ex : gènes de la fixation de l'azote ou de la dénitrification), constituant un indicateur robuste de la densité microbienne (Balloy et al., 2017; Mrad, 2018)

Synonymes : PCR quantitative du sol, biométrie moléculaire, Quantitative PCR, real-time PCR