métataxonomie
Définition
Approche de caractérisation des communautés microbiennes basée sur le séquençage à haut débit d'amplicons de gènes marqueurs (ARNr 16S pour les bactéries, ITS pour les champignons) (Lemanceau, 2020). Cette méthode permet d'identifier la diversité taxonomique et la composition d'un microbiome à partir de l'ADN extrait directement du sol ou de la rhizosphère (Lemanceau, 2020)