descripteur fonctionnel du microbiome

Caractéristique ou indicateur décrivant non pas l'identité taxonomique des membres d'un microbiome mais ce qu'ils peuvent faire — potentiel métabolique, activités enzymatiques, voies fonctionnelles exprimées. Le concept de réactobiome en est une déclinaison, agrégeant les capacités de réponse et d'adaptation fonctionnelle d'un consortium microbien face à une perturbation. Ces descripteurs s'appuient sur des approches omiques (métagénomique fonctionnelle, métatranscriptomique, métaprotéomique) et complètent les inventaires de diversité par une lecture opérationnelle de l'écosystème microbien.