dynamique évolutive des microbiomes

Processus par lequel les communautés microbiennes associées à un hôte (plante, animal, humain) changent de composition, de structure et de fonctions au fil des générations, sous l'effet combiné de la sélection naturelle, de la dérive génétique, du transfert horizontal de gènes et des modifications environnementales. La coévolution sol-microbiome-humain en est une facette : les microbiotes du sol, des plantes et de l'intestin humain ont évolué en interaction étroite depuis l'émergence de l'agriculture, voire au-delà, façonnant mutuellement leurs capacités métaboliques et immunitaires. Cette perspective évolutive éclaire les déséquilibres (dysbioses) induits par les modes de vie modernes.