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Le Sol Vivant

unité taxonomique opérationnelle

EN : operational taxonomic unit standard

Définition

Regroupement opérationnel de séquences d'ADN environnemental sur la base d'un seuil de similarité (typiquement 97 % pour le gène 16S rRNA procaryote), utilisé comme indicateur indirect de l'espèce en écologie microbienne moléculaire. Permet l'analyse de la diversité et de la structure des communautés sans recours à l'isolement culturable. Les unités taxonomiques virales (vOTUs) étendent ce concept aux communautés virales, avec des seuils de regroupement adaptés.