Microbiome environnemental

Ensemble des communautés microbiennes (bactéries, archées, champignons, virus) et de leurs génomes colonisant un écosystème donné — sol, cours d'eau, atmosphère. Ce microbiome constitue le réservoir de diversité fonctionnelle qui alimente les cycles biogéochimiques et les interactions hôte-microbe à toutes les échelles du vivant.