Métabarcoding ITS/16S
Définition
Technique de séquençage à haut débit ciblant des gènes marqueurs spécifiques pour caractériser la diversité taxonomique des communautés microbiennes : le gène de l'ARNr 16S pour les bactéries/archées et la région ITS pour les champignons (Carriconde et al., 2019; Djemiel et al., 2022). Cette approche permet d'identifier des milliers d'unités taxonomiques opérationnelles à partir d'un échantillon environnemental sans nécessiter de mise en culture (Barro, 2021; Foulon, 2016; Procopio et al., 2020)