diversité alpha
Définition
Mesure de la biodiversité microbienne au sein d'un échantillon unique ou d'un écosystème local (Cassol et al., 2023; Shahnavaz, 2009). Elle intègre généralement deux composantes : la richesse (nombre de taxons ou d'unités taxonomiques opérationnelles - OTU) et l'équitabilité (répartition des abondances relatives entre les taxons) (Cameron et al., 2021; Kumar et al., 2014). Les indices de Shannon et de Simpson sont les métriques les plus couramment utilisées pour caractériser cette diversité à l'échelle de la prise d'essai (Cassol et al., 2023; Jeanne et al., 2022; Kumar et al., 2014)