Exposome chimique alimentaire et microbiote — additifs, résidus, perturbateurs

Il est crucial de distinguer les plastiques conventionnels (p. ex. polyéthylène, PET) des alternatives dites biodégradables ou biosourcées, comme l'acide polylactiqueBiopolymère thermoplastique biodégradable synthétisé par polymérisation de l'acide lactique issu de ressources renouvelables comme le maïs ou l'amidon (Deroiné et al., 2014; Jaouadi, 2023). Sa dégradation s'opère par l'hydrolyse des liaisons esters, suivie d'une assimilation microbienne transformant le polymère en dioxyde de carbone et en eau, processus dont la cinétique dépend étroitement de la température, de l'humidité et de l'activité biologique du milieu (Ali et al., 2023; Armentano et al., 2013; Fatma, 2017). → Vocabulaire (Zhu et al., 2025).

• Biodégradabilité incomplète : Contrairement aux idées reçues, le PLA est souvent compostable industriellement, mais il se dégrade incomplètement dans l'environnement naturel et se transforme en oligomères dans le tractus gastro-intestinal (Ali et al., 2023 ; Liang et al., 2024).
• Production de nanoplastiques oligomères : Dans le tractus gastro-intestinal, les enzymes intestinales peuvent catalyser la fragmentation des microplastiques de PLA en nanoplastiques oligomères (Liang et al., 2024). Ces particules nanométriques présentent une biodisponibilité accrue et peuvent induire une toxicité supérieure à celle des plastiques conventionnels, notamment par une inflammation aiguë et des effets neurotoxiques exacerbés (Wang et al., 2023 ; Liang et al., 2024).

L'effet « Cheval de Troie » (vectorisation de polluants) est intrinsèquement lié à l'état de surface de la particule. Il existe une différence fondamentale entre les plastiques « vierges » (issus de la production industrielle) et les plastiques « altérés » (vieillis) présents dans l'environnement (Han et al., 2021) :

• Modification des propriétés de surface : L'exposition aux UV et l'abrasion physique (vieillissement) créent des groupes fonctionnels oxygénés et augmentent la porosité de la surface (Han et al., 2021).
• Cinétique d'adsorption accrue : Ces plastiques altérés présentent une capacité d'adsorption des métaux lourds (cuivre, zinc, plomb) significativement plus élevée (parfois d'un ordre de grandeur) que celle des plastiques vierges (Han et al., 2021). En seulement 10 jours de vieillissement accéléré, un microplastique peut doubler sa capacité d'adsorption de polluants chimiques (Harraq et al., 2022).

L'ingestion de ces particules, qu'elles soient vierges ou chargées de contaminants, modifie l'écosystème intestinal :

• DysbioseRupture de l'équilibre écologique (eubiose) au sein d'une communauté microbienne, caractérisée par une perte de diversité taxonomique, une modification des fonctions métaboliques et souvent une prolifération de microorganismes potentiellement pathogènes (Armetta, 2022; Zeng et al., 2016). La dysbiose intestinale est étroitement liée à des facteurs environnementaux (alimentation, antibiotiques) et constitue un moteur central de nombreuses maladies inflammatoires, métaboliques et neurologiques chez l'hôte (Bäckhed et al., 2012; Khan et al., 2024; Martinez et al., 2021) → Vocabulaire structurelle : L'ingestion de MNP provoque une perte de résilience du microbiote, souvent associée à une signature microbienne pro-inflammatoire (Jiménez-Arroyo et al., 2022).
• Niche écologique (« Plastisphère ») : Les microplastiques hébergent leur propre microbiote qui peut favoriser le transport de pathogènes opportunistes tout au long du tractus digestif (Fournier et al., 2021 ; Hirt & Body–Malapel, 2020).

Cette perspective souligne l'importance d'une approche globale :

• Le cycle de vie du plastique : Un plastique qui vieillit dans le sol ou l'eau peut adsorber des polluants (Alimi et al., 2021).
• Risque des alternatives : Le remplacement des plastiques conventionnels par des alternatives biodégradables pourrait, paradoxalement, augmenter l'exposition humaine aux nanoplastiques toxiques si les conditions de dégradation ne sont pas totalement maîtrisées (Liang et al., 2024).
  L'exposome anthropogénique moderne se définit donc par une interaction complexe entre la nature du polymère, son histoire environnementale et sa capacité à se fragmenter en entités nanométriques capables de franchir les barrières biologiques (Zhu et al., 2025).

Il est désormais nécessaire de distinguer les effets sur la composition du microbioteLe microbiote se définit comme l'ensemble des microorganismes (bactéries, virus, champignons, archées) vivant dans un environnement spécifique et interagissant avec son écosystème (Écale, 2021; Rochefort, 2020). Contrairement au "microbiome" qui inclut souvent la dimension génomique, le microbiote désigne spécifiquement la communauté taxonomique présente dans un hôte ou un habitat donné (Bousset, 2020; Nguyen, 2016) → Vocabulaire de ceux sur la fonction barrière. Comme le démontrent les travaux récents de Panyod et al., tous les agents de texture ne sont pas délétères pour l'interface mucus-microbiote (Panyod et al., 2024).

• L'exception des lipophiles : Les mono- et diglycérides, largement utilisés dans les produits de boulangerie (Abedi-Firoozjah & Tavassoli, 2024), se distinguent par leur capacité à réduire significativement la distance entre les bactéries et les cellules épithéliales intestinales (Panyod et al., 2024). Ce phénomène d'empiètement bactérien dans la couche de mucus interne pourrait contribuer à l'inflammation de bas grade et aux troubles métaboliques associés (Panyod et al., 2024).
• La relative sécurité des hydrophiles : À l'inverse, des émulsifiants comme la lécithine et les esters d'acides gras de saccharose n'entraînent ni amincissement de la couche de mucus, ni raccourcissement du côlon, ni colite induite, préservant ainsi l'intégrité physique de la barrière (Panyod et al., 2024).
• Nuances métaboliques : Bien que considérés comme sûrs pour la barrière de mucus, ces additifs ne sont pas neutres. La lécithine et les esters de saccharose induisent néanmoins une dysbiose en modifiant la diversité microbienne et en augmentant certains genres bactériens associés aux maladies (Panyod et al., 2024). Les esters de saccharose peuvent également augmenter la perméabilité intestinale et les niveaux de LPS circulants, suggérant un mécanisme de passage des endotoxines indépendant de l'érosion du mucus (Panyod et al., 2024).

Parallèlement à ces additifs de texture, les contaminants chimiques comme le glyphosateHerbicide total et systémique qui agit en inhibant l'enzyme EPSP synthase (5-énol-pyruvyl-shikimate-3-phosphate synthase), bloquant ainsi la synthèse des acides aminés aromatiques essentiels (phénylalanine, tyrosine, tryptophane) chez les végétaux (Carpentier et al., 2020; Reboud et al., 2018). Absorbé par les feuilles, il migre dans toute la plante jusqu'aux systèmes racinaires, entraînant la nécrose des tissus (Bonny, 2008; Laamari, 2016) → Vocabulaire agissent par une inhibition sélective de la voie du shikimate, présente chez certaines bactéries commensales. Cette sélectivité peut créer un avantage compétitif pour des pathogènes opportunistes, exacerbant la dysbiose initiale induite par une alimentation ultra-transformée (Walsh et al., 2023).

Cette distinction est capitale pour les stratégies de substitution. Privilégier la lécithineMélange complexe de phospholipides, principalement de la phosphatidylcholine, naturellement présent dans toutes les membranes cellulaires animales et végétales (Bognolo & Holmberg, 2026; Gaudry et al., 2012). En technologie alimentaire, elle est utilisée comme émulsifiant pour stabiliser les gouttelettes lipidiques et favoriser la formation de micelles ou de liposomes, influençant ainsi la digestion et le métabolisme des lipides (Bot et al., 2021; Robert et al., 2019). → Vocabulaire au détriment des MDG (mono- et diglycérides) modifie les propriétés viscoélastiques et la stabilité des émulsions, des paramètres essentiels dans le choix des ingrédients de remplacement (Lapčí­ková et al., 2024).
L'exposome chimique alimentaire doit donc être analysé comme une matrice complexe où la synergie entre la nature chimique de l'additif et l'état initial du microbiote détermine le franchissement ou non du seuil de pathogénicité (Erisa, 2026).

Les modèles animaux fournissent aujourd'hui un faisceau d'indices concordants sur le potentiel de toxicitéCapacité d'une substance (xénobiotique, métal lourd, pesticide) à provoquer des effets néfastes sur un organisme vivant (Gervillier, 2008; Temgoua, 2020). Elle est évaluée par des paramètres comme la dose journalière admissible ou la concentration sans effet prévisible et peut être qualifiée d'aiguë, subchronique ou chronique selon la durée d'exposition (Mamy et al., 2008; Temgoua, 2020) → Vocabulaire intestinale des micro- et nanoplastiques (Djouina et al., 2024).

• Observations sur modèles murins : Des études de référence, comme celles de Liang et al. ou Zhang et al., démontrent qu'une exposition continue aux MNP (notamment le polystyrène) induit une réduction de l'expression des protéines de jonction serrée, une diminution de l'épaisseur du mucus et une apoptose des cellules épithéliales médiée par le stress oxydatif (Liang et al., 2021 ; Zhang et al., 2023). Ces altérations conduisent mécaniquement à une augmentation de la perméabilité intestinale, ou « hyperperméabilité intestinale » (Liang et al., 2021 ; Chen et al., 2022).
• Transposition à l'humain et limites : La littérature la plus récente souligne que ces résultats ne peuvent être extrapolés sans précaution à l'humain (Dávalos et al., 2026 ; Symeonides et al., 2024). L'hétérogénéité des doses (souvent supérieures aux doses environnementales), des types de polymères et l'absence de protocoles standardisés limitent la portée des conclusions cliniques (Symeonides et al., 2024). Plutôt qu'une confirmation définitive, il convient de parler d'une corrélation mécaniste robuste : les MNP sont structurellement capables d'interagir avec les barrières biologiques, mais l'ampleur de cet effet chez l'humain reste à quantifier précisément (Covello et al., 2024 ; Dávalos et al., 2026).

Le débat actuel se cristallise sur la directionnalité de l'association observée :

• Les MNP comme initiateurs : L'ingestion chronique déclenche une inflammationRéponse immunitaire complexe déclenchée par des récepteurs reconnaissant des pathogènes ou des cellules endommagées, visant à restaurer l'homéostasie après une infection, une blessure ou une exposition à des contaminants (Ashley et al., 2012) → Vocabulaire de bas grade qui, à terme, fragilise la barrière et favorise la translocation systémique des particules et des endotoxines bactériennes (Devorkin et al., 2026).
• L'effet « amplificateur » d'un intestin lésé : Une hypothèse alternative suggère qu'un intestin déjà inflammé (cas des patients atteints de MICI) présente une perméabilité accrue qui favorise l'accumulation de MNP dans les tissus, créant ainsi une boucle de rétroaction positive qui aggrave la pathologie préexistante (Devorkin et al., 2026 ; Dávalos et al., 2026).

Malgré ces incertitudes, les données préliminaires établissent un lien entre la charge de MNP dans les fèces humaines et la sévérité des symptômes des MICI (Dávalos et al., 2026). Cela suggère que, même en l'absence de causalité directe démontrée pour l'initiation de la maladie, les MNP agissent comme des cofacteurs de l'exposome qui exacerbent les réponses immunitaires et perturbent les mécanismes de réparation tissulaire (Covello et al., 2024 ; Hirt & Body–Malapel, 2020).
La recherche s'oriente désormais vers l'identification de biomarqueurs de l'exposition aux plastiques et la compréhension de l'effet « cocktail » — l'interaction entre les polymères et les polluants qu'ils vectorisent — pour affiner cette évaluation du risque (Prata et al., 2021 ; Symeonides et al., 2024).

Le concept de Reactobiome — l'ensemble des réactions biochimiques microbiennes en réponse aux agressions chimiques — s'inscrit directement dans la lignée du XénobiomeEnsemble des interactions dynamiques entre les xénobiotiques (polluants, médicaments, additifs) et les communautés microbiennes d'un organisme ou d'un environnement (Abdelsalam et al., 2020). Le microbiome possède un potentiel métabolique direct sur ces composés, influençant leur toxicité et leur biodisponibilité, tandis que les xénobiotiques peuvent induire des dysbioses (Abdelsalam et al., 2020; Gruszecka-Kosowska et al., 2022; Torres-Sánchez et al., 2022). → Vocabulaire (Claus et al., 2016). Ce dernier définit la capacité du microbiote à métaboliser, détoxifier ou, parfois, activer la toxicité des composés environnementaux (Ampatzoglou et al., 2022). Dans une perspective One Health Microbiome, le Reactobiome devient une interface critique où la résilience fonctionnelle de l'écosystème intestinal détermine le seuil de toxicité systémique des xénobiotiques (Ampatzoglou et al., 2022 ; Ortíz et al., 2022).

Pour que le microbioteLe microbiote se définit comme l'ensemble des microorganismes (bactéries, virus, champignons, archées) vivant dans un environnement spécifique et interagissant avec son écosystème (Écale, 2021; Rochefort, 2020). Contrairement au "microbiome" qui inclut souvent la dimension génomique, le microbiote désigne spécifiquement la communauté taxonomique présente dans un hôte ou un habitat donné (Bousset, 2020; Nguyen, 2016) → Vocabulaire soit pris en compte dans l'évaluation des risques, il doit sortir de la recherche académique pour être intégré aux protocoles d'évaluation (Ampatzoglou et al., 2022).

• Feuille de route de l'EFSA : Le rapport de Moreno et al., issu du projet RIMICIA, propose une stratégie de priorisation des composés alimentaires (additifs, contaminants) susceptibles de perturber le microbiome (Moreno et al., 2024).
• Normalisation des tests : L'objectif est d'intégrer des biomarqueurs du microbiome dans les lignes directrices de l'EFSA, permettant de passer d'une évaluation de la toxicité aiguë à une analyse de l'impact sur les fonctions métaboliques et la barrière intestinale (Merten et al., 2020 ; Moreno et al., 2024).

La mise en place de leviers de réduction nécessite une approche nuancée pour éviter les effets de substitution délétères.

• Nuancer l'usage des émulsifiants : Plutôt qu'une interdiction globale, une stratégie de substitution sélective est recommandée, notamment pour les mono- et diglycérides dont l'impact négatif sur la barrière muqueuseInterface biologique constituée d'une couche de mucus sécrétée par les cellules caliciformes et les glandes sous-muqueuses, recouvrant les épithéliums digestifs, respiratoires et urogénitaux. Dans le côlon, le mucus riche en mucines forme deux couches : une externe lâche abritant le microbiote commensal, et une interne dense et stérile assurant l'étanchéité. Renforcée par les IgA sécrétoires et les peptides antimicrobiens, cette barrière protège l'épithélium contre pathogènes et toxines. Sa dégradation par des émulsifiants alimentaires ou un régime pauvre en fibres favorise l'empiètement bactérien et l'inflammation de bas grade. → Vocabulaire a été démontré (Panyod et al., 2024).
• Le paradoxe des plastiques biodégradables : Le passage à des alternatives comme l'acide polylactique (PLA) doit être abordé avec prudence. Des recherches récentes démontrent que, lors d'une dégradation incomplète dans le tractus gastro-intestinal, le PLA génère des nanoplastiques oligomériques (Liang et al., 2024 ; Wang et al., 2023). Ces particules présentent une bioaccessibilité accrue et induisent une inflammation aiguë ainsi que des effets neurotoxiques supérieurs à ceux des plastiques conventionnels, complexifiant ainsi les stratégies de réduction de la pollution plastique.

L'alimentation peut stimuler la résilience du Reactobiome.

• Diversité métabolique : Une alimentation riche en fibres et polyphénols favorise des processus microbiens qui participent à la détoxification et à la limitation de la toxicitéCapacité d'une substance (xénobiotique, métal lourd, pesticide) à provoquer des effets néfastes sur un organisme vivant (Gervillier, 2008; Temgoua, 2020). Elle est évaluée par des paramètres comme la dose journalière admissible ou la concentration sans effet prévisible et peut être qualifiée d'aiguë, subchronique ou chronique selon la durée d'exposition (Mamy et al., 2008; Temgoua, 2020) → Vocabulaire intestinale (Zapico et al., 2022).
• Bioremédiation intestinale : L'identification de taxons bénéfiques capables de dégrader des pesticides comme le glyphosate ouvre la voie à de nouveaux outils de santé publique dans le cadre d'une approche One Health intégrée (Matsuzaki et al., 2023 ; Ampatzoglou et al., 2022).
  En ancrant le Reactobiome dans ces cadres réglementaires émergents, nous intégrons le microbiote dans les stratégies d'évaluation des risques liés à la charge chimique anthropogénique (Gruszecka-Kosowska et al., 2022).

Cet axe fonctionne comme un système de communication bidirectionnelle où les micro-organismes circulent et coévoluent (Ma et al., 2025).

• L'interface de l'« Edible Microbiome » : La consommation de plantes crues (fruits et légumes frais) représente une voie majeure d'introduction de micro-organismes bénéfiques dans le tube digestif (Kostić et al., 2025 ; Sessitsch et al., 2023). On estime, par exemple, qu'une seule pomme peut contenir environ 100 millions de cellules bactériennes, dont une partie s'intègre au microbioteLe microbiote se définit comme l'ensemble des microorganismes (bactéries, virus, champignons, archées) vivant dans un environnement spécifique et interagissant avec son écosystème (Écale, 2021; Rochefort, 2020). Contrairement au "microbiome" qui inclut souvent la dimension génomique, le microbiote désigne spécifiquement la communauté taxonomique présente dans un hôte ou un habitat donné (Bousset, 2020; Nguyen, 2016) → Vocabulaire intestinal (Sessitsch et al., 2023).
• Transfert de résilience : Ces microbes d'origine environnementale — ou « microbiote alimentaire » — ne sont pas de simples passagers. Ils enrichissent la diversité alpha du microbiote humain, qui a considérablement diminué avec l'urbanisation et l'agriculture intensive (Ma et al., 2025 ; Blum et al., 2019). Ce transfert est crucial pour maintenir une barrière intestinale fonctionnelle capable de résister aux agressions de l'exposome chimique (Rosier et al., 2025).

Pour ancrer cette réflexion dans les standards de la toxicologie moderne, il convient d'introduire deux concepts clés :

• Le XénobiomeEnsemble des interactions dynamiques entre les xénobiotiques (polluants, médicaments, additifs) et les communautés microbiennes d'un organisme ou d'un environnement (Abdelsalam et al., 2020). Le microbiome possède un potentiel métabolique direct sur ces composés, influençant leur toxicité et leur biodisponibilité, tandis que les xénobiotiques peuvent induire des dysbioses (Abdelsalam et al., 2020; Gruszecka-Kosowska et al., 2022; Torres-Sánchez et al., 2022). → Vocabulaire : Il désigne la composante du microbiote (humain ou environnemental) dédiée à la transformation et à la détoxification des xénobiotiques (Claus et al., 2016). Un sol sain, riche en biodiversité microbienne, produit des plantes dont le microbiote associé possède déjà des capacités de dégradation des polluants, préconditionnant ainsi le système digestif humain à la gestion de la charge chimique (Ma et al., 2025 ; Pamel et al., 2023).
• Le One Health Microbiome : Ce concept souligne que la santé humaine est indissociable de la « santé microbienne » de notre environnement (Trinh et al., 2018). Une perte de biodiversité dans le sol, induite par des pratiques agricoles intensives, réduit la qualité du transfert microbien vers l'humain, créant un vide biologique qui exacerbe la sensibilité aux maladies métaboliques et inflammatoires (Blum et al., 2019).

L'état actuel de la recherche suggère que le continuum sol-intestin n'est pas seulement une voie d'exposition passive, mais un levier de bioremédiation naturelle (Ma et al., 2025).

• Effet protecteur : Les populations consommant des produits issus d'une agriculture régénérative présentent un microbiote plus diversifié et des marqueurs d'inflammationRéponse immunitaire complexe déclenchée par des récepteurs reconnaissant des pathogènes ou des cellules endommagées, visant à restaurer l'homéostasie après une infection, une blessure ou une exposition à des contaminants (Ashley et al., 2012) → Vocabulaire plus faibles, suggérant que la diversité microbienne du sol compense en partie les effets délétères des contaminants environnementaux (Ma et al., 2025).
• Causalité circulaire : Ce n'est pas seulement l'absence de polluants qui protège ces populations, mais la présence active de taxons « ancestraux » issus du sol, dont le rôle dans la restauration potentielle des fonctions métaboliques de l'intestin est en cours d'exploration (Blum et al., 2019).
  En conclusion, l'axe sol-plante-intestin doit être géré comme un patrimoine biologique commun. Protéger la biodiversité du sol, c'est préserver le microbiome humain, garantissant ainsi notre capacité intrinsèque à limiter les effets de l'exposome chimique alimentaire (Ma et al., 2025).

Malgré l'ambition du Plan d'Action Conjoint One Health, le rôle des communautés microbiennes dans la médiation de la toxicité chimique est resté longtemps sous-estimé. Ce « vide microbiologique » dans les politiques de santé publique a conduit à des évaluations des risques centrées sur l'hôte humain, négligeant le rôle de sentinelle et de filtre du microbioteLe microbiote se définit comme l'ensemble des microorganismes (bactéries, virus, champignons, archées) vivant dans un environnement spécifique et interagissant avec son écosystème (Écale, 2021; Rochefort, 2020). Contrairement au "microbiome" qui inclut souvent la dimension génomique, le microbiote désigne spécifiquement la communauté taxonomique présente dans un hôte ou un habitat donné (Bousset, 2020; Nguyen, 2016) → Vocabulaire (Moreno et al., 2024).
Cependant, des initiatives structurantes commencent à combler cette lacune :

• Le projet RIMICIA : Sous l'impulsion de Moreno et al., une feuille de route concrète a été établie pour intégrer le microbiome gastro-intestinal dans les évaluations des risques de l'EFSA (Moreno et al., 2024).
• Normalisation et OCDE : Ces travaux visent à standardiser l'inclusion de biomarqueurs microbiens dans les lignes directrices de l'OCDE, permettant de mesurer non seulement la toxicité directe des composés (comme le glyphosate ou les MNP), mais aussi leur impact sur la capacité de détoxification du xenobiome (Ampatzoglou et al., 2022).

L'approche One Health doit évoluer d'une simple surveillance des risques vers une stratégie d'inoculation de la résilience. Le continuum « sol-plante-humain » ne doit plus être perçu uniquement comme un vecteur de polluants, mais comme une interface de transfert de santé.

• L'interface sol-plante comme vecteur positif : La consommation de végétaux issus de systèmes régénératifs facilite le transfert de microbiotes bénéfiques du sol vers l'intestin humain, contribuant directement à la diversité alpha et à la résilience du reactobiome humain (Ma et al., 2025).
• Inoculation microbienne : Les plantes consommées crues fonctionnent comme des vecteurs de microbes essentiels qui « éduquent » le système immunitaire et renforcent la barrière muqueuseInterface biologique constituée d'une couche de mucus sécrétée par les cellules caliciformes et les glandes sous-muqueuses, recouvrant les épithéliums digestifs, respiratoires et urogénitaux. Dans le côlon, le mucus riche en mucines forme deux couches : une externe lâche abritant le microbiote commensal, et une interne dense et stérile assurant l'étanchéité. Renforcée par les IgA sécrétoires et les peptides antimicrobiens, cette barrière protège l'épithélium contre pathogènes et toxines. Sa dégradation par des émulsifiants alimentaires ou un régime pauvre en fibres favorise l'empiètement bactérien et l'inflammation de bas grade. → Vocabulaire, compensant ainsi l'appauvrissement microbien lié aux régimes alimentaires ultra-transformés (Rosier et al., 2025 ; Sessitsch et al., 2023).
• Agriculture de conservation et santé : En protégeant la biodiversité du sol, les pratiques régénératives en préservent les fonctions de bioremédiation, réduisant à la source la bioaccessibilité des contaminants tout en maximisant l'apport en micro-organismes protecteurs (Rosier et al., 2025 ; Yan et al., 2022).

La gestion de l'exposome chimique alimentaire exige un changement de paradigme. Il ne suffit plus de limiter l'exposition aux xénobiotiques ; il faut restaurer les capacités de réponse biologique de l'individu par la préservation de son Reactobiome.
Cette doctrine augmentée repose sur trois piliers :

• Prudence réglementaire : Intégrer la complexité des alternatives « biodégradables » (comme le PLA) et la sélectivité des additifs dans les évaluations de sécurité (Liang et al., 2024 ; Panyod et al., 2024).
• Transversalité microbiologique : Reconnaître l'interconnexion entre la santé du sol, le microbioteLe microbiote se définit comme l'ensemble des microorganismes (bactéries, virus, champignons, archées) vivant dans un environnement spécifique et interagissant avec son écosystème (Écale, 2021; Rochefort, 2020). Contrairement au "microbiome" qui inclut souvent la dimension génomique, le microbiote désigne spécifiquement la communauté taxonomique présente dans un hôte ou un habitat donné (Bousset, 2020; Nguyen, 2016) → Vocabulaire des plantes et l'homéostasie intestinale humaine (Ma et al., 2025 ; Sessitsch et al., 2023).
• Opérationnalisation politique : Soutenir les feuilles de route de type RIMICIA pour faire du microbiome un standard d'évaluation de la santé environnementale (Moreno et al., 2024).
  En réhabilitant le rôle du microbiote comme interface entre l'exposome et la santé, nous passons d'une toxicologie réactive à une médecine préventive et environnementale, ancrée dans la réalité biologique du vivant (Berg et al., 2020 ; Prata et al., 2021).