indice de diversité de Shannon
Définition
Mesure mathématique (souvent notée ) utilisée pour quantifier la diversité alpha d'une communauté microbienne en tenant compte à la fois de la richesse (nombre de taxons) et de l'équitabilité (répartition des abondances) (Kim et al., 2017; Monaco et al., 2020). Il exprime l'incertitude liée à la prédiction de l'identité d'un individu prélevé au hasard : plus l'indice est élevé, plus la communauté est diversifiée et équilibrée (Hellal et al., 2016; Hugerth & Andersson, 2017; Liao et al., 2023)