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Le Sol Vivant

Singletons

EN : singletons standard

Définition

Dans les analyses de métabarcoding (16S, ITS), désigne les unités taxonomiques opérationnelles ou variantes de séquences représentées par une seule lecture dans l'ensemble d'un jeu de données (Huse et al., 2010; Reitmeier et al., 2021). Bien que souvent écartés pour réduire le bruit lié aux erreurs de séquençage, ils peuvent représenter jusqu'à 58 % de la diversité totale et constituent un réservoir critique de la "rare biosphère" (Gobet et al., 2011; Jousset et al., 2017; Wen et al., 2017)

Synonymes : séquences uniques, OTU uniques, singleton OTUs, unique reads