compartiment sédimentaire

Compartiment de l'environnement constitué par les sédiments — marins, lacustres, fluviaux ou terrestres — appréhendés comme un milieu structuré par des gradients physico-chimiques verticaux. Dans la colonne sédimentaire, la stratification des accepteurs d'électrons (oxygène, nitrate, manganèse, fer, sulfate, dioxyde de carbone) organise des zones biogéochimiques successives où dominent des guildes microbiennes spécifiques. La zone de transition sulfate-méthane (SMTZ), interface où le sulfate diffusant depuis l'eau sus-jacente rencontre le méthane remontant des couches profondes, est un sous-compartiment fonctionnel clé : elle héberge les archées méthanotrophes anaérobies (ANME) couplées aux bactéries sulfato-réductrices, régulant ensemble le flux de méthane vers l'atmosphère.