Microbiome de la graine : transmission verticale et héritage fonctionnel

La graine n'est pas stérile : elle transmet verticalement un consortium microbien (bactéries endophytes + champignons) qui influence la germination, la croissance précoce et la résilience de la plantule. Ce microbiome seed-borne est acquis par deux voies complémentaires : (1) transmission verticale depuis la plante mère (systémique, via le phloème et les ovules), et (2) transmission horizontale depuis l'environnement (sol, air, carpopore).

Héritage fonctionnel : le microbiome de la graine prime la réponse immunitaire du plantule (ISR), fixe l'azote atmosphérique (Azospirillum, Bacillus), et solubilise le phosphore. C'est un bootloader écologique — le premier microbiome que la plantule rencontre est celui que sa mère lui a légué, pas celui du sol.

Érosion domestiquée : les cultivars modernes ont perdu une partie de cette diversité microbienne ancestrale. Les wild relatives (espèces sauvages apparentées) conservent un microbiome seed-borne plus riche — source potentielle de rediversification. L'ingénierie du seed microbiome (inoculation ciblée des semences) émerge comme levier de restauration.