Composition taxonomique
Définition
Inventaire qualitatif et quantitatif des taxons (phyla, genres, OTU ou ASV) présents dans un échantillon environnemental. Déterminée par metabarcoding des gènes marqueurs (16S rRNA, ITS, 18S rRNA) ou par métagénomique shotgun, la composition taxonomique constitue un indicateur de la structure des communautés microbiennes et de leur réponse aux pratiques agricoles et aux gradients environnementaux.