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Le Sol Vivant

Métagénomique shotgun

EN : shotgun metagenomics standard

Définition

Technique de séquençage aléatoire de l'intégralité de l'ADN extrait d'un échantillon environnemental, permettant d'étudier simultanément la diversité taxonomique et le potentiel fonctionnel des communautés microbiennes sans biais d'amplification ciblée (Goutorbe, 2022; Guyomar, 2018). Elle offre une image quantitative globale du matériel génétique, incluant les gènes métaboliques et les éléments mobiles (Ballaud, 2015; Barro, 2021)

Synonymes : métagénomique globale, métagénomique plein-génome, shotgun metagenomics, whole-genome metagenomics