Biomarqueurs fonctionnels du sol vivant : diagnostic par activités et ratios plutôt que par stocks

Principe : un biomarqueur fonctionnel = un proxy mesurable d'un mécanisme de la cascade biophysique. Lu conjointement avec le redox de terrain (Eh), il forme l'arsenal protocolaire du diagnostic.

Principaux biomarqueurs du corpus (non exhaustif) :

• Activités enzymatiques — phosphatase (minéralisation du P organique), cellulases (décomposition des résidus carbonés).
• Génétique fonctionnelle — nifH (potentiel de fixation d'azote, prédictif), métabarcoding 16S/ITS (diversité bactérienne et fongique).
• Indices écologiques — indice de Bongers (maturité des nématodes, succession trophique), QBS-ar (mésofaune, Parisi 2005), ratio F:B par PLFA (structure de la communauté).
• Efficience et stœchiométrie — CUE (Carbon Use Efficiency : allocation du C entre nécromasse/MAOM et CO₂ respiré), stœchiométrie de Kirkby (CNPS, arbitrage minéralisation/immobilisation).
• Vigueur métabolique végétale — Brix (solides solubles de la sève ; proxy de terrain indicatif, non spécifique), polyphénols et profil minéral foliaire (stress, qualité nutritionnelle).
• Diagnostic redox in situ — Eh de terrain (mV/cm), potentiel redox spatialisé.

Lecture transversale : ces biomarqueurs articulent les six macro-axes de la cascade biophysique (eau, structure, biologie, fertilité chimique, racines, vigueur). Ils opérationnalisent le « diagnostic par activités » plutôt que « par stocks » — rupture avec l'agronomie classique (qui surveille surtout MO totale, NPK, CEC), nécessaire pour piloter la dynamique d'une transition.