Escherichia coli
Définition
Bactérie à Gram négatif appartenant à la famille des Enterobacteriaceae. En microbiologie environnementale, elle est utilisée comme le principal indicateur de contamination fécale des eaux et des sols (Sartory & Vandevenne, 2008). Sa persistance dans les agrosystèmes, notamment après l'épandage de matières fertilisantes d'origine résiduaire, est influencée par les conditions pédoclimatiques et la compétition avec la flore microbienne indigène (Houot et al., 2014). Sa détection repose classiquement sur l'activité de l'enzyme β-glucuronidase (Sartory & Vandevenne, 2008)