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Le Sol Vivant

qSIP

EN : qSIP (quantitative Stable Isotope Probing) standard

Définition

Extension quantitative de la technique de marquage isotopique stable qui combine l'ultracentrifugation en gradient de densité et des modèles mathématiques pour quantifier l'enrichissement isotopique (ex: ¹³C, ¹⁵N, ¹⁸O) au niveau de chaque taxon (Hungate et al., 2015; Nuccio et al., 2022). Cette méthode permet d'estimer précisément les taux de croissance, de mortalité et la consommation de substrats spécifiques par les populations microbiennes dans leur environnement naturel (Hungate et al., 2015; Kleiner et al., 2023). Elle offre une résolution taxonomique fine pour distinguer les membres actifs d'une communauté (Emerson et al., 2017; Uhlík et al., 2012).

Synonymes : SIP quantitatif, marquage isotopique quantitatif, quantitative Stable Isotope Probing, qSIP