Souche technologique
Définition
Souche microbienne sélectionnée, optimisée et caractérisée pour la production industrielle d'un bioproduit cible (biocarburant, biopharmaceutique, protéine recombinante, additif alimentaire, métabolite secondaire, solvant) dans un bioprocédé en environnement contrôlé, alliant performances de production (productivité, rendement, titre, productivité volumique) et robustesse de fabrication (tolérance au pH, température, osmolarité, solvants, stress oxydatif et toxicité du produit final) (Ariff, 2009; Mishra & Chavda, 2026). La conception d'une souche technologique s'appuie sur la reprogrammation génétique de l'organisme catalytique pour rediriger sa machinerie cellulaire vers la production de la molécule d'intérêt, en s'appuyant sur la connaissance précise des voies métaboliques et de leur distribution des flux (mesurable par RMN ¹³C et spectrométrie de masse couplée au bilan des flux métaboliques) (Ariff, 2009; Szyperski, 1998). La chaîne de développement va du tube à essai à la bouteille via une séquence d'étapes intégrées (génération, récupération, purification, formulation, conditionnement), en conformité avec les Bonnes Pratiques de Fabrication (cGMP) imposées selon la classe de produit (biopharmaceutiques vs. aliments/ingrédients) (Ariff, 2009).