Archées : troisième domaine écologiquement distinct dans le sol
Les Archées forment le 3ᵉ domaine du vivant, distinct des Bacteria et des Eukarya (Woese 1977). Dans les sols, elles sont systématiquement sous-évaluées par les méthodes microbiennes standard, calibrées sur les bactéries. Deux lignées dominent en pédologie, une troisième étant marginale en sols tempérés :
- Thaumarchaeota — AOA, nitrification des sols oligotrophes et acides (amoA archéen) ;
- Euryarchaeota — méthanogènes en anaérobiose stricte (rizières, tourbes, intestins) ;
- Crenarchaeota sensu stricto — essentiellement thermophiles, faiblement représentés en sols tempérés (les « créarchéotes » mésophiles du sol ont été reclassés en Thaumarchaeota — Brochier-Armanet et al. 2008).
Rôle diagnostique : le ratio AOA/AOB révèle le régime de fertilité ; la présence de méthanogènes signale une anaérobiose persistante. Implication : en systèmes régénératifs à faible pression azotée, les AOA prennent le relais des AOB pour la nitrification — il faut changer la grille d'analyse microbienne.
Cards en dialogue (12)
- Approfondit
- Approfondi par
- Voir aussi (9)
-
- Redox central : gradients, microzones et 'redox ladder'
- Profil sol hydromorphe/organique : redox bas, émissions, gestion de l’eau centrale
- Azote (formes, pertes) → stœchiométrie → stratégies microbiennes
- Cycle de l'azote : fixation, minéralisation, nitrification, pertes
- Continuum sol-plante-humain : le fil rouge du corpus
- rH2, capacité redox et poising capacity : au-delà de l'Eh ponctuel
- Voies aérobie (cob) et anaérobie (cbi) de biosynthèse de la vitamine B12 : architecture évolutive divergente
- Bactéries ferro-réductrices : Geobacter, Shewanella et la respiration dissimilatoire du fer
- Couplages biogéochimiques Fe-P-S-N sous alternance redox : vivianite, NDFO et gouvernance des nutriments