Neocallimastigomycota

Phylum regroupant des champignons anaérobies stricts dépourvus de mitochondries, habitant le système digestif des herbivores ruminants et non-ruminants (Gruninger et al., 2014; Mizrahi & Jami, 2018). Ces microorganismes sont les premiers colonisateurs des tissus végétaux ingérés ; grâce à leurs rhizoïdes et un arsenal enzymatique puissant (cellulases, hémicellulases), ils fracturent physiquement les parois lignocellulosiques, facilitant ainsi le travail ultérieur des bactéries fibrolytiques (Fonty et al., 1988; Gordon & Phillips, 1998; Zhang et al., 2020)