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Le Sol Vivant

transcriptome

EN : transcriptome validé

Définition

Ensemble des ARN messagers transcrits par le génome d'un organisme, d'un tissu ou d'une cellule à un moment donné et dans des conditions physiologiques spécifiques. L'analyse transcriptomique, par séquençage RNA-seq ou puces à ADN, révèle les gènes différentiellement exprimés en réponse à des stimuli environnementaux. En biologie des sols, le transcriptome des micro-organismes et des racines éclaire les dialogues moléculaires de la rhizosphère — activation des gènes de symbiose mycorhizienne, de défense systémique ou de détoxification des métaux lourds.