Mycobiome intestinal et axe gut-brain fongique : le 3ᵉ domaine oublié de la santé humaine
Le mycobiome intestinal ne représente que 0,1-1 % de la biomasse microbienne intestinale mais contribue de façon disproportionnée à la physiologie via des métabolites très actifs (β-glucanes immunomodulateurs, mycoestrogènes, mycotoxines).
Acteurs principaux : Candida (C. albicans commensal/opportuniste, C. glabrata résistante aux azolés, C. auris multirésistante émergente) ; Saccharomyces (cerevisiae, et boulardii probiotique) ; Malassezia ; Aspergillus, Penicillium (transitoires alimentaires) ; Mucor, Rhizopus.
Axe gut-brain fongique, trois voies :
- vagale — le nerf vague détecte la dysbiose et module les circuits cérébraux ;
- humorale — les β-glucanes activent des cytokines systémiques (TNF-α, IL-6, IL-17) atteignant le cerveau via une barrière hémato-encéphalique perméabilisée ;
- métabolique — des mycotoxines (ochratoxine A, gliotoxine) traversent la barrière et modulent l'axe tryptophane/kynurénine.
Associations neurodégénératives documentées (au stade d'hypothèses) : Candida dans le cerveau post-mortem de patients Alzheimer (Pisa 2015 — très contestée : risque de contamination post-mortem, non répliquée indépendamment) ; dysbiose mycobiote précoce dans Parkinson ; signatures pro-inflammatoires dans dépression, TSA, schizophrénie.
Lien au continuum sol-plante-humain : les spores environnementales (sol, aérobiologie, aliments fermentés, produits frais) colonisent l'intestin et y produisent des métabolites bioactifs — les pratiques agricoles modifient l'aérobiologie fongique. Angle mort méthodologique : le séquençage ITS (champignons) reste très sous-utilisé face au 16S (bactéries), d'où une sous-détection systémique du mycobiome.
Cards en dialogue (17)
- Voir aussi (16)
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- CEP : double identité entomopathogène/endophyte et CBC
- Résistome et transfert horizontal : la face sombre du continuum
- Redondance fonctionnelle et résilience coévolutive (H5/DP4)
- Mémoire transgénérationnelle plante-microbiome
- Phages et transduction des ARG : réservoir silencieux du résistome
- Cascade des conséquences — E0 parcelle → E5 planétaire (jusqu'où ça ricoche)
- Éliciteurs biologiques exogènes : chitosane et oligogalacturonides (priming PTI/SAR)
- IPMO (Indigenous Predatory Microorganisms) : cultiver ses propres prédateurs pour pilotage biotique
- Axe sucre simple → dysbiose intestinale → maladie cardiométabolique
- Quorum Quenching One Health : désarmement enzymatique des pathogènes vs antibiorésistance
- Carence silencieuse en cobalt et transfert trophique sol-plante-microbiome humain : pendant Co du continuum sol-aliment-santé
- Successions microbiennes de la fermentation lactique : continuum sol -> récipient -> tube digestif
- Immunité nutritionnelle : forme d'azote (NH₄⁺/NO₃⁻) → protéosynthèse → signalisation JA-SA
- Le tube digestif comme bioréacteur anaérobie : principe convergent du fermenteur intestinal (ver, ruminant, humain)
- Acides gras à chaîne courte (AGCC) : pivot fibres → barrière → immunité → axe intestin-cerveau
- Banque de semences microbienne dormante : prophages, persisters et spores, le réservoir invisible